Komisje realizują zadania wynikające z ustawowych i statutowych zadań KRASP: analizują i opiniują akty prawne, rozpatrują wnioski, przygotowują projekty uchwał etc. Posiedzenia komisji, w składzie których zasiadają obecni i byli rektorzy, odbywają się zależnie od stanu prac i bieżących potrzeb środowiska akademickiego.

• Komisja ds. Infrastruktury Informacyjnej

• Komisja ds. Organizacyjnych i Legislacyjnych

• Komisja ds. Kształcenia

• Komisja ds. Ekonomicznych

• Komisja ds. Nauki i Innowacji

• Komisja ds. Współpracy Międzynarodowej

• Komisja Akredytacyjna

• Komisja Rewizyjna

• Zespół Boloński